Thông qua hoạt động kiểm tra, giám sát, các sở, ngành nắm được tình hình thực hiện các ý tưởng khởi nghiệp của thanh niên, thống kê được những khó khăn, vướng mắc để kịp thời tham mưu UBND tỉnh giải quyết và nhận định những mô hình hay, cách làm hiệu quả để nhân rộng trong hệ sinh thái khởi nghiệp trong thanh niên tại địa phương.
Với mục tiêu hoạt động không vì lợi nhuận, an toàn nguồn vốn, không để nợ xấu và mất vốn; Quỹ Khởi nghiệp tỉnh luôn thực hiện công tác kiểm tra, kiểm soát trước, trong và sau khi giải ngân, qua đánh giá, các phương án hoạt động ổn định, hoạt động hiệu quả.
Ban đại diện Chi nhánh Ngân hàng Chính sách xã hội cấp tỉnh, cấp huyện và bộ phận kiểm tra của Chi nhánh Ngân hàng Chính sách xã hội tỉnh thường xuyên được tăng cường; hàng năm, đã xây dựng kế hoạch và thực hiện công tác kiểm tra toàn diện các mặt hoạt động, kiểm tra chuyên đề, kiểm tra định kỳ và đột xuất nhằm đảm bảo an toàn trong hoạt động tín dụng chính sách xã hội. Công tác phối hợp với tổ chức chính trị - xã hội nhận ủy thác (Đoàn Thanh niên, Hội Nông dân, Hội Liên hiệp Phụ nữ, Hội Cựu Chiến binh các cấp) về quản lý nguồn vốn khá tốt, công tác giám sát vốn vay được thuận lợi và vốn tín dụng chính sách của Nhà nước đến tận tay người thụ hưởng một cách nhanh chóng, thông suốt, bảo đảm công khai, dân chủ, tạo ra hiệu quả kinh tế, chính trị, xã hội to lớn.
Tỉnh đoàn hướng dẫn Đoàn Thanh niên các cấp phân công cụ thể, rõ ràng việc theo dõi nguồn vốn, phối hợp tổ chức kiểm tra các mô hình, dự án phát triển kinh tế trong thanh niên, đặc biệt là về các nguồn vốn của Trung ương Đoàn, vốn ủy thác của Chi nhánh Ngân hàng Chính sách xã hội tỉnh và cấp huyện thông qua tổ chức Đoàn Thanh niên.
Qua các đợt kiểm tra cho thấy, nguồn vốn sử dụng đúng mục đích, có hiệu quả, trả nợ, lãi đúng hạn.